Après avoir créé en 2005 un bureau d'études spécialisé sur les questions d'aménagement du territoire, Frédéric Grosjean est maître de conférences en géographie à l'Université de Franche-Comté (Laboratoire Théma) depuis 2008. Ses recherches s’orientent aujourd’hui dans le domaine de la relation formation-emploi, en croisant notamment les questions de territoires et d'insertion professionnelle des jeunes et des adultes (mobilités géographiques scolaires et professionnelles).